NRIG scan operating Manual

[ 개요 ]
- 본 scan은 tester contrast calibration / ref scan 1 / tester scan 6 / ref scan 1로 구성되어 있다.


[ tester contrast calibration ]

1. testerContCalib1219.m을 실행한다. 이때 HID device를 설정하는 부분이 나오면 SIK가 알려준 device ID를 입력한다.
2. scan을 실시하는 장소와, 피험자 ID를 입력한다.
3. 이후의 모든 과정은 scanner 안에 있는 피험자가 조작하게 된다.
4. calibration is over 라는 메세지가 화면에 뜨면,  ref scan을 시작한다.

[ T1 imaging ]
1. 이 실험에서는 T1 imaging을 실험전에 실시할 것이다.

 
[ reference scan ]

1. ref scan은 실험 scan 앞뒤로 1번씩 실행할 것이다. 프로그램은 refScanForOSX_1p2TRv2.m 이다.
2. 프로그램을 실행하면 실험 장소와 HID device #를 물어볼 것이다. 이전 tester contrast calibration 프로그램과 동일하게 입력하면 된다.
3. 이미지가 만들어지고 난 후 피험자가 scanner 안쪽에서 준비되었다는 표시로 버튼을 누를 것이다. 그럼 피험자가 보는 화면의 메세지가 ' Ref scan is ready to stat'로 바뀐다. 이때 operator 선생님께 scan을 시작해달라고 이야기하면 된다.
4. 이때 dummy TR은 자동으로 걸러내고 실험이 시작한다.
5. 17cycle의 자극이 play된 후에 ref scan을 다시 시작할 것이냐는 질문이 command line에 뜨면 과감히 0을 눌러 ref scan을 종료시킨다.
6. scan의 길이는 170 TR / 204 sec 이고, TR은 1.2s이다.


[ exp scan ]

1. exp scan은 before adapt / after adapt 로 나누어지며, 총 6 scan이다. 이것은 run_DispAdapt_SIK1219_1backRot.m 프로그램 하나로 다 진행된다.
2. 프로그램을 실행시키면, 실험장소와 device ID에 대해서 물어본다. 이때 적절히 선택하면 된다.
3. 이미지가 만들어지고 난 후에 before adapt scan은 바로 scan ready 상태가 된다. 즉, scan이 시작되어 TTL sync신호가 들어오면 바로 실험이 시작되는 상태다.
4. 이렇게 3번의 before adapt scan이 진행된다. 각 scan이 끝날때 다음 scan으로 진행하겠냐는 메세지가 나오면 enter를 눌러준다.

5. 4번째 scan부터는 long adaptation 후에 scan이 시작된다. long adaptation은 피험자가 시작하며, 피곤할 경우에는 이때 쉴 수 있다.
6. 피험자가 long adaptation을 시작하면 60초 동안 long adaptation 자극이 화면에 나타나게 된다. 이때 시간의 진행 상황은 command line에 나타난다. 이 시간이 60초가 다 되면 operator 선생님께 scan을 시작해달라고 이야기하면 된다. TTL sync 신호가 들어오면 프로그램은 자동적으로 시작된다.
7. 한 scan이 끝나면 마찬가지로 scan을 시작하겠냐는 메세지가 나오고 이때 enter를 눌러주면 된다.

8. 모든 scan이 종료되면 다시 ref scan을 한번 더 한다. 이때 절차는 앞서 설명한 것과 동일하다.

9. exp scan의 경우 scan의 길이는 210 TR / 252 sec 이고, TR=1.2s 로 ref scan과 동일하다.